L'initiative SEPA repose sur trois piliers :

• La Commission européenne a posé un choix politique dans le cadre de l'Agenda de Lisbonne.
  Aux termes de cet agenda, l'UE doit devenir, d'ici 2010, l'économie de la connaissance la plus compétitive et la plus dynamique au monde.
• Les principaux objectifs du SEPA et le calendrier de sa mise en œuvre ont été fixés par la Banque centrale européenne.
• Le secteur bancaire a prévu de développer ceux-ci et de les intégrer dans le cadre de l'autorégulation menée par le European Payments Council, un organe de décision du secteur bancaire européen.